DNA Mikroarray Metoder

30. December 2015

DNA Mikro array er en teknik som hører under en gruppe teknikker som kaldes for, BOC (Biology on a chip) og går i alt sin enkelthed ud på at man tager, 2 celle kulturer (altså dvs. nogle celler) og dyrker dem sammen, i 2 forskellige reagens glas, man dyrker dem typisk i en vandig aminosyre og glukose blanding.

Eksempel

Lad os bare sige at vi skal lave et anti-kræft lægemiddel. Hvordan ville du gribe den opgave an? Tjaeh hvis du har fulgt mine artikler her på stedet så ville du jo nok sige ved at bruge Bioinformatik eller Røntgen Krystallografi. Så ville jeg sige først så skal vi lige have et Bio-target (Altså identificeret det protein vi skal angribe) og den smarteste måde at gøre dette på er ved at bruge DNA Mikroarray.

Hvordan?

Okay men hvordan pokker gør man? Metoden er som følger, først så tager man nogle kræft celler (sikkert fra en biopsi fra en kræft patient) og dernæst så tager man nogle raske celler og blander dernæst kræft cellerne med den før omtalte væske i et reagens glas, og dernæst så tager man de raske celler og gør det samme i et reagens glas. Så lader man blandingerne stå i et par dage, og herefter suger man så væskerne væk, og tilsætter noget MRNA (Messenger RNA det er den form for RNA som fortæller ribosomerne* hvilken aminosyre sekvens proteinerne skal have) ekstrahations væske.

Væsketyper

Der findes forskellige væsker til at gøre dette, De mest anvendte er Lysozyme's* flydende nitrogen, og til sidst men ikke mindst en sur væske altså PH < 7. dernæst så separer man MRNA'en det er bla. derfor denne metode hører under metoderne biologi på en chip metoden til at gøre dette er at man tager MRNA og lægger det på en glas plade, hernæst så tilsætter man så nogle vilkårlige DNA strenge som har egenskaben Fluroscent* og så ser man så om DNA'en binder med MRNA'en. Og så ser man så på om DNA binder med MRNA'en (hydrogen bindinger) og adskiller så DNA'en fra MRNA igen.

Når alt det ovenstående så er gjort så suger man væsken med MRNA'en op med en pipette. Det næste man så gør er noget der kaldes Reverse transcription PCR (Polymerase Chain Reaction, Bagvendt Polymerase Kæde Reaktion red.) og hernæst kan man så bruge Bioinformatik 

****

Ribosomerne er cellernes protein fabrikker, disse er faktisk nogle kæmpe store enzymer der både kan aflæse en MRNA streng og samle aminosyrer til proteiner.

Lysozymes er en gruppe enzymer der ødelægger peptid bindingerne* i proteiner vores spyt indeholder dem faktisk.

Fluroscent er egenskab visse molekyler har, som gør at hvis de bliver belyst så kaster de selv lys tilbage.

Peptid bindinger er de kemiske bindinger der holder vores proteiner sammen, og de har altid formen C-N-C=O.

MENU
0-100 | 100-200 | 200-300 | 300-400 | 400-500 | 500-600 | 600-700 | 700-800 | 800-900 | 900-1000 | 1000-1100 | 1100-1200 | 1200-1300 | 1300-1400 | 1400-1500 | 1500-1600 | 1600-1700 | 1700-1800 | 1800-1900 | 1900-2000 | 2000-2100 | 2100-2200 | 2200-2300 | 2300-2400 | 2400-2500 | 2500-2600 | 2600-7200 | 2700-2800 |